Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc174Q3U155 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms