Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trappc9Q3U0M1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms