Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Shcbp1lQ3TTP0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms