Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim43aQ3TL54 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim43aQ3TL54 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms