Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rundc1Q0VDN7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rundc1Q0VDN7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms