Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cntnap5bQ0V8T8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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