Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Vps8Q0P5W1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vps8Q0P5W1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms