Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn2bQ0KL01 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms