Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtprgQ05909 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtprgQ05909 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms