Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox10Q04888 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox10Q04888 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms