Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Col6a2Q02788 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms