Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gbp1Q01514 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbp1Q01514 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms