Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gfra1P97785 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms