Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nbr1P97432 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nbr1P97432 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms