Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd13P70217 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd13P70217 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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