Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Rpl39P62892 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms