Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Lmo4P61969 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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