Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nphp4P59240 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms