Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PctpP53808 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PctpP53808 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PctpP53808 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PctpP53808 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PctpP53808 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PctpP53808 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PctpP53808 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PctpP53808 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms