Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
FmodP50608 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
FmodP50608 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
FmodP50608 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
FmodP50608 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms