Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gli1P47806 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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