Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nedd4P46935 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms