Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gdf5P43027 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gdf5P43027 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gdf5P43027 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gdf5P43027 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gdf5P43027 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gdf5P43027 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gdf5P43027 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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