Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Defa2P28309 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms