Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl3P27659 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl3P27659 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms