Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
NelfeP19426 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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