Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LIG1P18858 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LIG1P18858 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms