Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trim30aP15533 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim30aP15533 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim30aP15533 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim30aP15533 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms