Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FosbP13346 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FosbP13346 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FosbP13346 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FosbP13346 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms