Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cxcl2P10889 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cxcl2P10889 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cxcl2P10889 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms