Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01747 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01747 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01747 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01747 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms