Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Ccl20O89093 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccl20O89093 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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