Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Timm44O35857 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Timm44O35857 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms