Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Slc1a6O35544 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Slc1a6O35544 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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