Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Slc18a3O35304 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Slc18a3O35304 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Slc18a3O35304 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms