Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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H2-Q1O19441 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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H2-Q1O19441 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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H2-Q1O19441 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
H2-Q1O19441 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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H2-Q1O19441 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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H2-Q1O19441 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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H2-Q1O19441 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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H2-Q1O19441 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
H2-Q1O19441 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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