Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hps1O08983 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hps1O08983 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hps1O08983 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hps1O08983 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hps1O08983 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hps1O08983 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hps1O08983 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hps1O08983 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hps1O08983 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hps1O08983 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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