Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sema3aO08665 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms