Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gm379J3QQ19 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm379J3QQ19 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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