Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm17535J3KMR8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms