Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm28038F7BCN9 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms