Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Krtap11-1E9Q2E9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms