Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms