Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb4A2A863 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb4A2A863 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms