Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm3550W4VSN7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms