Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cldn7Q9Z261 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms