Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ripk3Q9QZL0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms