Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Gpc1Q9QZF2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
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Gpc1Q9QZF2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Gpc1Q9QZF2 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Gpc1Q9QZF2 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Gpc1Q9QZF2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Gpc1Q9QZF2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Gpc1Q9QZF2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Gpc1Q9QZF2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
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Gpc1Q9QZF2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Gpc1Q9QZF2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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Gpc1Q9QZF2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Gpc1Q9QZF2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms