Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms