Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Csnk1eQ9JMK2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Csnk1eQ9JMK2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms